Et endoskop er en bøjelig og flexibel kikkert som bruges til se indvendigt i spiserør , mavesæk og tolvfingertarm. Desuden kan man også undersøge i  endetarm og tyktarm, men dette kræver at dyret er helt tømt for afføring. Endoskopet føres ind via mundhulen ved undersøgelse af spiserør, mavesæk og tolvfingertarm, og via endetarmsåbningen, når det er endetarm eller tyktarm, der skal undersøges.
Gennem kanaler i endoskopet er det muligt at indføre instrumenter, der kan udtage biopsier og indsprøjte og udtage væsker. Biopsier er en uvurderlig hjælp til at stille den rigtige diagnose i forbindelse med forandringer i mave-/tarmkanalen.
Undersøgelserne foretages under bedøvelse, ikke på grund af smerte, men fordi dyrene skal ligge stille og ikke bide i det kostbare apparatur.